Михаил Фёдорович Лукин родился 6 (18) ноября 1892 года в деревне Полухтино, ныне Зубцовского района Тверской области в крестьянской семье. Окончил 5 классов сельского училища народного просвещения. С июля 1918 года в Красной Армии.
В 1918 году окончил курсы разведчиков при Полевом штабе РККА. Вступил в ВКП(б) в августе 1919 года. Активный участник Гражданской войны в России. С декабря 1918 года воевал в составе 37-й стрелковой дивизии: помощник начальника штаба дивизии, командир 328-го стрелкового полка, командир 2-й стрелковой бригады. В рядах дивизии воевал на Южном, Юго-Восточном и Кавказском фронтах.
В феврале 1920 года был ранен. После госпиталя назначен начальником штаба 1-й Кавказской кавалерийской дивизии. С августа 1920 года командовал 94-м стрелковым полком 11-й стрелковой дивизии, с сентября 1920 года командовал бригадой в этой дивизии. В составе 15-й армии сражался в ходе советско-польской войны. За отличия в боях Гражданской войны награждён двумя орденами Красного Знамени.